Ο Εμμανουήλ Γαρουφάλλου είναι Αναπληρωτής Καθηγητής, Διευθυντής του Ερευνητικού Εργαστηρίου «ΜεταΔΕΔΟΜΕΝΩΝ, Διαχείρισης Πληροφοριών και Δεδομένων» (MetaDATA LAB) και Διευθυντής του Προγράμματος Διδακτορικών Σπουδών του Τμήματος Βιβλιοθηκονομίας, Αρχειονομίας και Συστημάτων Πληροφόρησης της Σχολής Κοινωνικών Επιστημών του Διεθνούς Πανεπιστημίου της Ελλάδος. Διδάσκει μεταξύ άλλων τα μαθήματα ‘Διαχείριση Συλλογών, Πληροφοριών και Ερευνητικών Δεδομένων’, ‘Ψηφιακές Βιβλιοθήκες, Ψηφιακά Αρχεία και Καταθετήρια’, και ‘Μεταδεδομένα, Ανοικτά Συνδεδεμένα Δεδομένα και Οντολογίες’. Έχει επιμεληθεί στην ελληνική γλώσσα από τις εκδόσεις Δίσιγμα τα βιβλία ΑΝΑΠΤΥΞΗ ΚΑΙ ΔΙΑΧΕΙΡΙΣΗ ΣΥΛΛΟΓΩΝ: βασικές αρχές και το ΜΕΤΑΔΕΔΟΜΕΝΑ της American Library Association.
Είναι μέλος του Γενικού Συμβουλίου Βιβλιοθηκών του Υπουργείου Παιδείας, Θρησκευμάτων και Αθλητισμού. Είναι Πρόεδρος του Διεθνούς Συνεδρίου Metadata and Semantics Research και έχει επιμεληθεί 10 βιβλία του με τον εκδοτικό οίκο Springer. Επίσης, είναι Editor-in-Chief στο Περιοδικό "International Journal of Metadata, Semantics and Ontologies" της Interscience και Editor στο Περιοδικό "Data Technologies and Applications" της Emerald. Έχει εκδώσει, παρουσιάσει και επιμεληθεί πάνω από 120 επιστημονικές εργασίες και μελέτες. Είναι μέλος της ομάδας έργου «ΜΕΛΟΣ: Μουσικές Ελληνικές Οπτικοακουστικές Συλλογές» και project manager του ευρωπαϊκού έργου «Digital competence and information literacy for librarians».